Nguyên nhân của sự cố này là do một nhân viên trực Đài kiểm soát không lưu không có mặt tại vị trí trong khi nữ kiểm soát viên không lưu trực chính thì... ngủ quên. Vi phạm này vô cùng nghiêm trọng khiến dịch vụ không lưu bị gián đoạn, uy hiếp an toàn bay.
Hiện, hai kiểm soát viên trên đã bị xử lý kỷ luật theo đúng quy định, đồng thời, Đài trưởng cũng bị đình chỉ nhiệm vụ.
Sau sự cố, về phía Cục Hàng không đang có những động thái rà soát, kiểm tra nhằm đảm bảo an toàn bay, tránh sự cố trong tương lai.